产品货号:
ALH164
中文名称:
λ噬菌体DNA提取试剂盒
英文名称:
Lambda phage genomic DNA Extraction Kit
产品规格:
50T|100T
发货周期:
1~3天
产品价格:
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本试剂盒适用于快速λ噬菌体DNA提取,将λ噬菌体裂解培养物离心后的上清,首先用RNase A/DNase I混合酶消化去除残留的宿主菌DNA/RNA,沉淀收集噬菌体,噬菌体被SDS裂解,残留碎片通过沉淀离心去除掉。裂解物上清中的λ噬菌体DNA在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜,再通过一系列快速的漂洗-离心的步骤,将盐、细胞代谢物、蛋白等杂质去除,最后低盐的洗脱缓冲液将λ噬菌体DNA从硅基质膜上洗脱。λ噬菌体载体广泛用于文库筛选,目的克隆培养获得大量的噬菌体颗粒需要提取λ噬菌体DNA来开展测序等后续工作。
- 不需要使用有毒的苯酚等试剂,也不需要乙醇沉淀等步骤。
- 节省时间,简捷,可用于液体培养裂解物和固体培养板提取,单个样品操作一般在1.5小时内完成。
- 产量高,典型的产量10mL λ噬菌体裂解培养物上清可以提取约10μg λ噬菌体DNA。
- 多次柱漂洗确保高纯度,OD260/OD280典型的比值达1.7~1.9。可以直接用来酶切和测序。
组分 | 50T | 100T | 保存 |
RNase A | 20mg | 20mg×2 | -20℃ |
DNase I | 50mg | 50mg×2 | |
噬菌体沉淀液 | 100mL | 100mL×2 | 室温 |
裂解缓冲液 | 30mL | 60mL | |
杂质沉淀液 | 5mL | 10mL | |
结合液LB | 20mL | 40mL | |
漂洗液WB | 13mL | 25mL | |
洗脱缓冲液EB | 10mL | 15mL | |
吸附柱AC及收集管(2mL) | 50套 | 100套 |
保存:室温,其中RNase A和DNase I需-20℃保存,有效期1年。
- 在RNaseA管和DNase I管分别加入1mL的裂解缓冲液吹打,颠倒混匀,充分溶解RNaseA和DNase I后,按照每次使用量分装-20℃冻存,有效期6个月。
- 结合液LB低温时可能出现析出和沉淀,可以在37℃水浴几分钟帮助重新溶解,恢复澄清透明后冷却到室温即可使用。
- 避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、pH值变化,各溶液使用后应及时盖紧盖子。
- 使用转速可以达到13000rpm的冷冻离心机。
- 开始实验前将需要的水浴先预热到37℃备用。
- 需要自备氯仿,20% SDS。
- 结合液LB含有刺激性化合物,操作时要戴乳胶手套,避免沾染皮肤,眼睛和衣服。若沾染皮肤、眼睛时,要用大量清水或者生理盐水冲洗。
以10mL噬菌体感染细菌培养上清提取举例
- 准备工作
第一次使用前请先在漂洗液WB中加入指定量无水乙醇,充分混匀,加入后请及时在方框打钩标记已加入乙醇,以免多次加入!
将噬菌体沉淀液放在冰上预冷。 - 操作步骤
- 将0.5%氯仿处理后的λ噬菌体感染的液体培养物10000g(约12000rpm)4℃离心10分钟去除细胞碎片和残渣。
- 转速不能过高,时间不能过长,否则噬菌体可能和碎片一起沉淀,降低产量。
- 取10mL上清,加入20μL RNase和20μL DNase充分混匀37℃温育30分钟。
- 每个噬菌体培养上清因生长和裂解情况不同而残留RNA/DNA量不等。RNase/DNase消化过头,可能减少产量;消化不完全,可能未消化的DNA/RNA和细胞碎片粘去部分噬菌体减低产量并/或者导致最后污染宿主菌DNA,因此应该根据实际情况适当调节用量和消化时间。
- 加入2mL预冷的噬菌体沉淀液,轻柔充分混匀后置冰上冷却(培养板裂解物必须在冰上放置30分钟)。
- 10000g(12000rpm)4℃离心10分钟,弃上清,干燥1分钟。沉淀下来的噬菌体外观为透亮或者稍白的沉淀。
- 加入500μL裂解缓冲液,吹打重悬噬菌体,加入100μL 20% SDS,立即轻柔颠倒混匀4~6次后,70℃温育10分钟,然后置冰上冷却。
- 加入100μL杂质沉淀液,立即轻柔颠倒混匀4~6次,最高速13000g 4℃离心10分钟。
- 仔细将上清转入新的离心管,加入350μL结合液LB,轻柔涡旋混匀。
- 将上述混合物加入一个吸附柱AC中,(吸附柱放入收集管中)12000rpm离心30秒,倒掉收集管中的废液。
- 吸附柱一次最多只可以容纳大约700μL混合物,因此需要分次把混合物上到吸附柱内,重复步骤8。
- 加入600μL漂洗液WB(请先检查是否已加入无水乙醇!),12000rpm离心30秒,弃废液。
- 可选步骤:重复步骤9一遍。
- 将吸附柱AC放回空收集管中,13000rpm离心2分钟,尽量除去漂洗液,以免漂洗液中残留乙醇抑制下游反应。
- 取出吸附柱AC,放入一个干净的离心管中,在吸附膜的中间部位加100μL洗脱缓冲液EB(洗脱缓冲液事先在50℃水浴中预热),室温放置1分钟,12000rpm离心1分钟。如果想得到较多量的DNA,可将得到的溶液重新加入离心吸附柱中,12000rpm离心1分钟。
- 洗脱体积越大,洗脱效率越高,如果需要DNA浓度较高,可以适当减少洗脱体积,但是最小体积不应少于40μL,体积过小降低DNA洗脱效率,减少DNA产量。
- DNA可以存放在2~8℃,如果要长时间存放,可以放置在-20℃。
- 将0.5%氯仿处理后的λ噬菌体感染的液体培养物10000g(约12000rpm)4℃离心10分钟去除细胞碎片和残渣。
问题 | 评论与建议 |
低核酸产量或者纯度不高 |
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宿主菌基因组DNA残留过高 |
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加入噬菌体沉淀剂后未见到λ噬菌体沉淀 |
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DNA下游酶切不能切开或者酶切不完全 |
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纯化的DNA产物D260数值异常偏高 |
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